Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cox8bP48772 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms