Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms