Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms