Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg3P47867 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg3P47867 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms