Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Rab11bP46638 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Rab11bP46638 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rab11bP46638 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rab11bP46638 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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