Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cdkn1bP46414 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms