Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms