Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms