Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sept1P42209 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sept1P42209 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms