Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TfamP40630 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TfamP40630 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TfamP40630 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TfamP40630 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TfamP40630 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TfamP40630 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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