Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VhlP40338 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VhlP40338 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VhlP40338 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VhlP40338 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VhlP40338 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VhlP40338 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VhlP40338 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VhlP40338 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms