Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf1P39428 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf1P39428 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms