Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms