Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6dP35459 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms