Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc1P34928 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms