Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms