Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VtnP29788 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VtnP29788 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VtnP29788 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VtnP29788 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VtnP29788 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VtnP29788 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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