Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp3P28862 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms