Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprmP28828 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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