Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxraP28700 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms