Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atxn10P28658 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms