Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Psmb9P28076 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms