Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde6aP27664 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms