Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U2af2P26369 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms