Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms