Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd247P24161 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms