Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ttll1-202ENSMUST00000109479 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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Hoxd11P23813 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Hoxd11P23813 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm16211-201ENSMUST00000147722 1620 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd11P23813 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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