Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms