Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

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Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HdcP23738 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HdcP23738 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HdcP23738 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HdcP23738 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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HdcP23738 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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HdcP23738 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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HdcP23738 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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HdcP23738 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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HdcP23738 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 687.4 ms