Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms