Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms