Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms