Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Edn1P22387 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms