Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SagP20443 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SagP20443 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SagP20443 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms