Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms