Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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