Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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