Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NefhP19246 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NefhP19246 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NefhP19246 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NefhP19246 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NefhP19246 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms