Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18532 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18532 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18532 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18532 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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