Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P18529 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P18529 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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P18529 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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P18529 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P18529 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P18529 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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