Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18527 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18527 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18527 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18527 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18527 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms