Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms