Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb3P17125 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms