Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmga1P17095 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms