Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgbP16014 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms