Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb1P12658 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms