Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp2P11378 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp2P11378 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms