Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fv4P11370 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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