Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P10404 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P10404 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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