Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Becn2P0DM65 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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